تقوم دائرة نظم المعلومات الجغرافية (GIS) بالمهام الرامية الى خلق قاعدة لمجموعة البيانات وتوثيق كافة المعلومات المتعلقة بحوض نهر الليطاني وإصدار الخرائط اللازمة والتوضيحية لحوض النهر ولمشاريع المصلحة  الوطنية لنهر الليطاني، بما فيها (المسح الشامل لكافة المؤسسات الواقعة في حوض النهر، مشاريع  الملحوظة لمعالجة التلوث في حوض نهر الليطاني، قنوات الري والمساحات المروية واملاك المصلحة  والاملاك النهرية ...) ومن ثم بناء قاعدة معلومات جغرافية.